Die musikalische Arbeit ist im Kirchenkreis eine der wichtigsten Säulen gemeindlicher Arbeit. Dazu sind im Kirchenkreis vier hauptamtliche Kantoren angestellt und viele nebenamtliche Organisten und Chorleiter tätig.

Die Kirchen im Altenburger Land sind nahezu alle mit Orgeln ausgestattet. Einer der bekanntesten Orgelbauer, der im Altenburger Land gewirkt hat. ist Johann Tobias Gottfried Trost. Weitere Orgeln wurden von der Orgelbauerfamile Poppe aus Stadtroda gebaut.Auch Orgeln der Orgelbauerfamilien Donati und Ladegast sind im Altenburger Land zu finden. Es ist ein sehr vielfältige Orgellandschaft.
Desweiteren gibt es in der Kirche in Ponitz noch ein besonderes Kleinod - eine Orgel von Gottfried Silbermann. Sie gehört zu den wenigen Orgeln, die von ihm außerhalb Sachsens gebaut wurde.

So gibt es neben der gottesdienstlichen Kirchenmusik ein reichhaltiges und vielfältiges Angebot von Konzerten und Kirchenmusiken, von der großen Stadtkirche bis zur kleinen Dorfkirche.

In vielen Kirchengemeinden finden wir Kirchenchöre, die ihr Gemeindeleben aktiv gestalten auch über die kirchenmusikalische Arbeit in den Gemeinden hinaus.

In Altenburg, Göpfersdorf, Ehrenhain, Gieba, Meuselwitz, Ponitz, Saara und Ronneburg sind die Bläser in der Posaunenchorarbeit aktiv.

Der Gospelchor Colours of Soul in Altenburg bringt zeitgenössische Musik in die Kirchen. Aber auch die Johanniter bringen mit Samba-Klängen von Como vento andere Töne in die Gemeinden.